Tạp chí  Khoa học Trường Đại học Phú Yên là cơ quan ngôn luận về khoa học của Trường Đại học Phú Yên đã được Bộ Thông tin và Truyền thông  cấp giấy phép và được Bộ Khoa học-Công nghệ cấp mã số chuẩn quốc tế ISSN (số 0866-7780). Tạp chí Khoa học nằm trong hệ thống báo chí thuộc sự quản lý về hoạt động báo chí của Sở Thông tin Truyền thông Phú Yên.

    Tạp chí Khoa học Trường Đại học Phú Yên là tạp chí khoa học đầu tiên của tỉnh được Bộ Khoa học - Công nghệ cấp mã chuẩn quốc tế. Bước đầu tạp chí đã có đóng góp tích cực cho hoạt động NCKH của CB-GV trong trường. Tạp chí đã trở thành cầu nối giữa đội ngũ trí thức khoa học và công nghệ của tỉnh nhà với đội ngũ trí thức khoa học và công nghệ các địa phương, các trường đại học trong toàn quốc.